Как подружить гены в клетках. Коктейль молодости, светящиеся котики, напечатанные органы и другие прелести науки - Ангелина Владимировна Потапова

29. Simeone, C. A., Andrews, J. P., Johnson, S. P. et al. (2022). Xenotransplantation of porcine progenitor cells in an epileptic California sea lion (Zalophus californianus): illustrative case, Journal of Neurosurgery: Case Lessons, 3(12), CASE21417. Retrieved Apr 27, 2023, from https://doi.org/10.3171/CASE21417.

30. Xuan, Y, Ghatak, S., Clark, A. et al. (2021). Fabrication and use of silicon hollow-needle arrays to achieve tissue nanotransfection in mouse tissue in vivo. Nat Protoc 16, 5707–5738. https://doi. org/10.1038/s41596-021-00631-0.

31. Dôhla, J., Kuuluvainen, E., Gebert, N. et al. (2022). Metabolic determination of cell fate through selective inheritance of mitochondria. Nat Cell Biol 24, 148–154. https://doi.org/10.1038/ S41556-021-00837-0.

Глава 6

1. Trujillo C.A., Rice E.S., Schaefer N.K at al. (2021, February 12). Réintroduction of the archaic variant of NOVAI in cortical organoids alters neurodevelopment. Science 371(6530). DOI: 10.1126/science.aax2537.

2. Neal, S., McCulloch, K.J., Napoli, F.R. et al. (2022). Cooption of the limb patterning program in cephalopod eye development. BMC Biol 20, 1 https://doi.org/10.1186/sl2915-021 -01182-2.

3. Poplawski, G.H.D., Kawaguchi, R., Van Niekerk, E. et al. (2020). Injured adult neurons regress to an embryonic transcriptional growth state. Nature 581, 77–82. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2200-5.

4. Lindborg, J.A., Tran, N.M., Chenette D.M. (2021, March 2). Optic nerve regeneration screen identifi es multiple genes restricting adult neural repair. Cell Reports 34(9), 108777. DOI: https://doi. org/10.1016/j.celrep.2021.108777.

5. Wang, W., Hu, Ch.-К., Zeng A., Alegre, D. et al. (2020, September 4). Changes in regeneration-responsive enhancers shape regenerative capacities in vertebrates 2020. Science, 369(6508). DOI: 10.1126/ science.aaz309.rep.2021.108777.

6. Gasparini, A. Researchers develop algorithm to compare cells across species. Retrieved 25 May 2021 from https://phys.org/news/2021-05-algorithm-cells-species.html.

7. Fon Tacer K., Montoy M.C., Oatley M.J., Lord T. et al. (2019, May 29). MAGE cancer-testis antigens protect the mammalian germline under environmental stress. Sci. Adv. 5(5): eaav4832. DOI: 10.1126/ sciadv.aav4832.

8. James F. Pelletier, Lijie Sun, Kim S. Wise Genetic requirements for cell division in a genomically minimal cell (2021, April 29). Cell 184(9), pp. 2430–2440.E16. https://doi.Org/10.1016/j. cell.2021.03.008.

9. Liu P., Chen M., Liu Y. et al. CRISPR-Based Chromatin Remodeling of the Endogenous Oct4 or Sox2 Locus Enables Reprogramming to Pluripotency (2018, February 1). Cell Stem Cell 22,252–261. https:// doi.org/10.1016/j.stem.2017.12.001 Retrieved from https://www.cell. com/cell-stem-cell/fulltext/S1934-5909(17)30501-5.

10. Elbaz J., Puri M.C., Faiz M. et al (2022, Dec 1). Highly efficient reprogrammable mouse lines with integrated reporters to track the route to pluripotency. PNAS. Vol. 119 | No. 49. https://doi.org/10.1073/ pnas.2207824119.

11. Ocampo A., Reddy P. et al (2016, December 15). In Vivo Amelioration of Age-Associated Hallmarks by Partial Reprogramming. Cell 167, 1719–1733. http://dx.doi.Org/10.1016/j.cell.2016.ll.052.

12. Browder, K.C., Reddy, P., Yamamoto, M. et al. (2022). In vivo partial reprogramming alters age-associated molecular changes during physiological aging in mice. Nat Aging 2, 243–253. https://doi. org/10.1038/s43587-22-00183-2.

13. Hirsch, T., Rothoeft, T., Teig, N. et al. (2017). Regeneration of the entire human epidermis using transgenic stem cells. Nature 551, 327–332. https://doi.org/10.1038/nature24487.

14. KueckelhausM.jM.D.,RothoeftT.,M.D.,LauraDeRosaetal.Transgenic Epidermal Cultures for Junctional Epidermolysis Bullosa – 5-Year Outcomes (2021, December 9). N Engl J Med 385: 2264–2270. DOI: 10.1056/NEJMoa2108544. Retrieved from https://www.nejm.org/ doi/full/10.1056/NEJMoa2108544?query=TOC&cid=NEJM%20 eToc,%20December%209,%202021%20DM530136_NEJM_Subscrib er&bid=731782855#figures_media.

15. Gammage, P.A., Viscomi, C., Simard, M.L. et al. (2018). Genome editing in mitochondria corrects a pathogenic mtDNA mutation in vivo. Nat Med 24,1691–1695. https://doi.org/10.1038/s41591-018-0165-9.

16. Silva-Pinheiro, P., Nash, P.A., Van Haute, L. et al. (2022). In vivo mitochondrial base editing via adeno-associated viral delivery to mouse post-mitotic tissue. Nat Commun 13, 750. https://doi. org/10.1038/s41467-022-28358-w.

17. Zhao H., Cheng Y., Kalra A. Generation and multiomic profiling of a TP53/CDKN2A double-knockout gastroesophageal junction organoid model (2022, November 30). Science translational medicine. Vol 14, Issue 673. DOI: 10.1126/scitranslmed.abq6146.

Благодарности

В подростковом возрасте у меня была мечта – написать свою книгу и издать ее. Но когда дело дошло до ее написания, меня стало одолевать сильное внутреннее сопротивление, прокрастинация и приступы синдрома самозванца. Даже сейчас, когда работа над книгой завершена, у меня периодически возникает страх, что ее прочтет кто-то из маститых ученых и она покажется ему недостойной. Но, как говорится, волков бояться – в лес не ходить. Поэтому хочу напоследок выразить слова благодарности тем, без кого эту книгу я не написала бы: редакторам, рецензентам, научным консультантам, корректорам, друзьям и родным.

В первую очередь спасибо Эльмире Якуповой – моей подруге-биологу, иллюстратору – за удивительно милые и необычные рисунки и ценные правки в тексте на протяжении долгой работы над книгой. Кажется, за то время, пока я писала эту книгу, она выучила ее наизусть!

Спасибо Марии Зеленовой – научному редактору – за терпение, поддержку и веру в книгу. Была проделана огромная работа, внесено множество правок, чтоб книга стала намного лучше. И если вдруг вы нашли где-то какую-то ошибку, скорее всего, Маша на нее мне указывала, но каким-то образом я это не учла или проигнорировала.

Хочу поблагодарить Александра Панчина, который прочитал черновой вариант книги и сказал: «Так не пойдет, давай дорабатывай!» При этом подсказал, что и как должно быть. Если бы я переработала книгу со всеми пожеланиями, она была бы невероятной. Но лень родилась раньше меня, поэтому есть, как есть. Но этот вариант в разы лучше черновика, поверьте!

Благодарю Марию Тутукину, она прочла черновой вариант моей книги и помогла выделить важные для читателя понятия.

Хочу поблагодарить издательство «Бомбора»: Мелине Ананян, которая вносила ценные правки и замечания, тем самым улучшив текст книги; Юлию Лаврову, которая была все время на связи и выслушивала мои «отмазки» по поводу еще не готового текста, мотивируя меня все же дописать эту книгу.

Спасибо моей сестре Светлане Кочкиной, которая пришла на помощь при работе со списком литературы, и Елизавете Абрамовой, которая на начальных этапах внесла существенный вклад в работу над текстом книги.

Спасибо моим дорогим друзьям и родным, которые верили в меня и в особенно сложные периоды поддерживали меня словом и делом: Елене Ягольник, Анастасии Рудневой, Анне Шляпниковой, Карине Костроминой, Анастасии Тихоновой, Алексею Кочкину, Василию Сысоеву, Саяну Дондокову, Сергею Антипову, Евгении Овчаренко. А также моим любимым родителям и сыну Брониславу, который за время написания книги подрос и стал интересоваться наукой.

Спасибо сотрудникам Института биофизики клетки РАН, особенно Владимиру Ивановичу Новоселову, Андрею Темнову и Алине Гордеевой за их огромный вклад в становлении меня как ученого и популяризатора науки.

Спасибо Российскому квантовому центру, центру LIFT и Сколтеху, в стенах которых мне наконец удалось завершить работу над этой книгой!